Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms