Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC5A6Q9Y289 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC5A6Q9Y289 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC5A6Q9Y289 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC5A6Q9Y289 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC5A6Q9Y289 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC5A6Q9Y289 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC5A6Q9Y289 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms