Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC3Q9UQE7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMC3Q9UQE7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms