Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNM6

PSMD13, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD13Q9UNM6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD13Q9UNM6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD13Q9UNM6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD13Q9UNM6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD13Q9UNM6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD13Q9UNM6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD13Q9UNM6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD13Q9UNM6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD13Q9UNM6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD13Q9UNM6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms