Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PCDHA4Q9UN74 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHA4Q9UN74 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA4Q9UN74 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA4Q9UN74 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA4Q9UN74 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA4Q9UN74 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA4Q9UN74 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA4Q9UN74 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA4Q9UN74 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA4Q9UN74 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA4Q9UN74 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA4Q9UN74 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms