Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNRGQ9UMZ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNRGQ9UMZ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNRGQ9UMZ2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms