Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN2Q9UL51 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN2Q9UL51 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN2Q9UL51 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN2Q9UL51 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN2Q9UL51 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN2Q9UL51 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN2Q9UL51 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCN2Q9UL51 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN2Q9UL51 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms