Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP45Q9UL16 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP45Q9UL16 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP45Q9UL16 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms