Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXL3Q9UKT7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL3Q9UKT7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL3Q9UKT7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL3Q9UKT7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL3Q9UKT7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL3Q9UKT7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL3Q9UKT7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL3Q9UKT7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL3Q9UKT7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL3Q9UKT7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXL3Q9UKT7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms