Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C3orf18Q9UK00 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms