Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL4Q9UJQ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL4Q9UJQ4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms