Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CTNNA3Q9UI47 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms