Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms