Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms