Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNG4Q9UBN1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG4Q9UBN1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms