Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A7Q9P2U7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC17A7Q9P2U7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms