Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGAP28Q9P2N2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms