Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNFX1Q9P2E3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNFX1Q9P2E3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNFX1Q9P2E3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNFX1Q9P2E3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNFX1Q9P2E3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNFX1Q9P2E3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNFX1Q9P2E3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNFX1Q9P2E3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNFX1Q9P2E3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNFX1Q9P2E3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNFX1Q9P2E3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms