Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP1Q9P0U3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP1Q9P0U3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms