Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms