Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MSRB1Q9NZV6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSRB1Q9NZV6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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