Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AIPL1Q9NZN9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AIPL1Q9NZN9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIPL1Q9NZN9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms