Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLGN3Q9NZ94 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms