Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC10Q9NYD6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC10Q9NYD6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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