Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 LINC00963-207ENST00000454635 910 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.356e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.676e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-206ENST00000453213 469 ntTSL 310.48□□□□□ -0.736e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-209ENST00000607931 473 ntTSL 510.23□□□□□ -0.776e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-219ENST00000624390 472 ntTSL 510.17□□□□□ -0.786e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-218ENST00000624138 261 ntTSL 58.93□□□□□ -0.986e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-215ENST00000622972 444 ntTSL 57.11□□□□□ -1.276e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-7■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-74■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.83□□□□□ -1.962e-74■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.131e-9■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 TBPL1-202ENST00000367869 623 ntTSL 322.07■■□□□ 1.121e-9■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.951e-9■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 TBPL1-205ENST00000457715 865 ntTSL 520.96■□□□□ 0.951e-9■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 TBPL1-204ENST00000416965 991 ntTSL 318.01■□□□□ 0.471e-9■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.011e-9■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-9■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 510.87□□□□□ -0.673e-48■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.253e-48■■■■□ 19.8
AATFQ9NY61 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.644e-7■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.54e-7■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.042e-6■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 522.08■■□□□ 1.122e-6■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.345e-10■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.915e-10■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 PPAN-205ENST00000446223 844 ntTSL 322.19■■□□□ 1.145e-10■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.895e-10■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.675e-10■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 321.88■■□□□ 1.093e-8■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.833e-8■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.113e-8■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.23e-8■■■■□ 19.6
AATFQ9NY61 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.621e-323■■■■□ 19.5
AATFQ9NY61 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 212.68□□□□□ -0.381e-323■■■■□ 19.5
AATFQ9NY61 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 512.15□□□□□ -0.471e-323■■■■□ 19.5
AATFQ9NY61 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 38.19□□□□□ -1.11e-323■■■■□ 19.5
AATFQ9NY61 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 58.12□□□□□ -1.111e-323■■■■□ 19.5
AATFQ9NY61 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.55□□□□□ -1.521e-323■■■■□ 19.5
AATFQ9NY61 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.08□□□□□ -1.61e-323■■■■□ 19.5
AATFQ9NY61 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.52□□□□□ -1.854e-72■■■■□ 19.4
AATFQ9NY61 NCL-210ENST00000494618 910 ntTSL 22.98□□□□□ -1.934e-72■■■■□ 19.4
AATFQ9NY61 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.119e-11■■■■□ 19.4
AATFQ9NY61 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 510.02□□□□□ -0.815e-6■■■■□ 19.3
AATFQ9NY61 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.275e-6■■■■□ 19.3
AATFQ9NY61 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.345e-6■■■■□ 19.3
AATFQ9NY61 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.371e-38■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.841e-38■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.231e-38■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.031e-38■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.081e-38■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-38■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.151e-38■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 HSPA8-215ENST00000532091 2301 ntTSL 512.48□□□□□ -0.411e-38■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-38■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.581e-8■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.472e-11■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.12e-11■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 ANKLE2-205ENST00000538591 886 ntTSL 310.62□□□□□ -0.712e-11■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 ANKLE2-211ENST00000545623 1288 ntTSL 39.67□□□□□ -0.862e-11■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 ANKLE2-204ENST00000535036 741 ntTSL 58.22□□□□□ -1.092e-11■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 CYC1-204ENST00000533444 1832 ntTSL 1 (best)31.13■■■□□ 2.571e-14■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.861e-14■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 522.39■■□□□ 1.171e-14■■■□□ 19.2
AATFQ9NY61 EIF4G1-233ENST00000475721 1271 ntTSL 224.33■■□□□ 1.494e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 223.49■■□□□ 1.354e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 ANK1-207ENST00000518061 892 ntTSL 318.45■□□□□ 0.544e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.274e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.074e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 EIF4G1-231ENST00000464548 637 ntTSL 515.37■□□□□ 0.054e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.014e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 EIF4G1-211ENST00000422614 750 ntTSL 512.72□□□□□ -0.374e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 ANK1-209ENST00000520299 3587 ntTSL 210.86□□□□□ -0.674e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 ANK1-214ENST00000524227 3825 ntTSL 1 (best)10.3□□□□□ -0.764e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)30.28■■■□□ 2.442e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.262e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.932e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 215.03■□□□□ -02e-7■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 DDX39B-204ENST00000418897 583 ntTSL 314.71□□□□□ -0.054e-32■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 DDX39B-213ENST00000456976 720 ntTSL 514.58□□□□□ -0.084e-32■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 DDX39B-205ENST00000419020 583 ntTSL 314.31□□□□□ -0.124e-32■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 DDX39B-209ENST00000428450 633 ntTSL 414.2□□□□□ -0.144e-32■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 ATP6V1G2-DDX39B-203ENST00000480131 552 ntAPPRIS P1 TSL 413.45□□□□□ -0.264e-32■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 DDX39B-211ENST00000449757 591 ntTSL 312.68□□□□□ -0.384e-32■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.854e-32■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.04□□□□□ -2.081e-323■■■□□ 19.1
AATFQ9NY61 LINC01138-207ENST00000638958 1395 ntTSL 521.36■■□□□ 1.014e-7■■■□□ 19
AATFQ9NY61 RNVU1-1-201ENST00000384610 164 ntBASIC11.62□□□□□ -0.554e-7■■■□□ 19
AATFQ9NY61 LINC01138-210ENST00000640832 1709 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.864e-7■■■□□ 19
AATFQ9NY61 PPAN-203ENST00000430370 594 ntTSL 315.02■□□□□ -01e-43■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.331e-43■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 ANKRD28-203ENST00000439830 592 ntTSL 530.89■■■□□ 2.547e-7■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.417e-7■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 ANKRD28-202ENST00000412318 4408 ntTSL 25□□□□□ -1.617e-7■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 529.03■■■□□ 2.242e-6■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 328.51■■■□□ 2.152e-6■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 227.77■■■□□ 2.042e-6■■■□□ 18.9
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