Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV2

KCTD5, BTB/POZ domain-containing protein KCTD5, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD5Q9NXV2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD5Q9NXV2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD5Q9NXV2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms