Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms