Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM161AQ9NX61 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms