Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL2Q9NX52 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms