Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH5Q9NX47 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms