Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM140Q9NV12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms