Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GJB4Q9NTQ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB4Q9NTQ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms