Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREX1Q9NSU2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms