Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPMQ9NSP4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms