Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms