Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL1Q9NSC2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SALL1Q9NSC2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms