Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INCENPQ9NQS7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms