Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRC4Q9NPP4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms