Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms