Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA8Q9NP80 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms