Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB18Q9NP72 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms