Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD248Q9HCU0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms