Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms