Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F12Q9HCS2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms