Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KIAA1549Q9HCM3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1549Q9HCM3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1549Q9HCM3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms