Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC22Q9HCG8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC22Q9HCG8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC22Q9HCG8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC22Q9HCG8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC22Q9HCG8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC22Q9HCG8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CWC22Q9HCG8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CWC22Q9HCG8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CWC22Q9HCG8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CWC22Q9HCG8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC22Q9HCG8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC22Q9HCG8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms