Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LY9Q9HBG7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LY9Q9HBG7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LY9Q9HBG7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LY9Q9HBG7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LY9Q9HBG7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LY9Q9HBG7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms