Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRABDQ9H4I3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms