Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIOBPQ9H2D6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIOBPQ9H2D6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms