Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GANQ9H2C0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GANQ9H2C0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms