Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC8Q9H0W5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC8Q9H0W5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC8Q9H0W5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms